Hélène Pasquier est actuellement chargée d'enseignement en histoire économique et sociale à l'Université de Neuchâtel. Elle mène également une étude financée par le Fonds National suisse de la recherche scientifique (FNRS) sur l'image de l'entreprise Suchard au travers de ses supports photographiques. En juin 2007, Hélène Pasquier a défendu sa thèse de doctorat en co-tutelle entre l'Université de Neuchâtel et l'Université de technologie de Belfort-Montbéliard. Elle a obtenu en 2004 une bourse de jeune chercheur du FNRS pour séjourner une année à Berlin. Invitée par la Technische Universität de Berlin, elle a pu ainsi approfondir sa formation et ses recherches dans les domaines de l'histoire des techniques et l'histoire d'entreprises.

Hélène Pasquier a publié en 2001 un premier ouvrage d'histoire économique, intitulé La chasse à l'hectolitre consacré à la politique de vente d'une brasserie régionale dans une économie de type cartellisée.